Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLFQ16534 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLFQ16534 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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