Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms