Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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