Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms