Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERC3Q15034 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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