Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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CHD4Q14839 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CHD4Q14839 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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