Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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EBI3Q14213 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
EBI3Q14213 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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