Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKAP5Q14008 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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