Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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