Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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