Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA7Q13683 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA7Q13683 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA7Q13683 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms