Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CUL4AQ13619 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CUL4AQ13619 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CUL4AQ13619 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CUL4AQ13619 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CUL4AQ13619 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4AQ13619 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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