Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPM6BQ13491 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms