Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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