Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN3Q13064 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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