Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms