Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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