Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2AQ12879 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
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