Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms