Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL9Q07325 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms