Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms