Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms