Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms