Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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