Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms