Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL1Q00532 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms