Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.2 ms