Protein–RNA interactions for Protein: P78318

IGBP1, Immunoglobulin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGBP1P78318 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGBP1P78318 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms