Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UFM1P61960 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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