Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BACE1P56817 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms