Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms