Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOSBP53539 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOSBP53539 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms