Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1P51787 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms