Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms