Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms