Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP4P49662 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP4P49662 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP4P49662 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP4P49662 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms