Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARCN1P48444 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms