Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RECQLP46063 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RECQLP46063 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RECQLP46063 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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