Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBP2P32456 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GBP2P32456 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBP2P32456 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms