Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA6P31267 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms