Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CRABP1P29762 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms