Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA6P23229 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms