Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL2P19875 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms