Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB6O95452 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms