Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK1O75385 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK1O75385 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK1O75385 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK1O75385 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms