Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNSO60931 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNSO60931 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNSO60931 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CTNSO60931 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNSO60931 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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