Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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