Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP104O60308 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP104O60308 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms