Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COCHO43405 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COCHO43405 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COCHO43405 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COCHO43405 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COCHO43405 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COCHO43405 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COCHO43405 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COCHO43405 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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