Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHGDHO43175 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms